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免疫检查点阻断数据库:尊龙凯时生物医疗解决方案

发布时间:2025-03-15   信息来源:尊龙凯时官方编辑

为了探索能够预测免疫检查点阻断(ICB)反应的生物标志物谱,研究者们开发了多种数据库和网络平台。这些资源不仅收集了转录组数据、总生存期、活检时间、免疫反应等信息,还整合了其他临床数据,用于生存分析、肿瘤微环境中的免疫细胞解卷积及差异表达基因分析等研究。本文将详细介绍几个主要数据库的特点及其提供的功能与分析工具。

免疫检查点阻断数据库:尊龙凯时生物医疗解决方案

01 ICBAtlas

尊龙凯时推出的ICBAtlas是一个专注于ICB疗法的数据库,整合了来自25个公共数据库的1,515名癌症患者的数据,涵盖9种癌症类型。它提供分析基因表达差异、定义响应评分以评估治疗效果与肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况的工具。该平台支持用户在基因、癌症类型或免疫检查点层面探索数据,旨在帮助识别生物标志物,推动个性化癌症免疫治疗的研究与改进。ICBAtlas对研究人员免费开放。

02 TIDE

TIDE分数是一种预测ICB疗法反应的计算方法,它通过分析肿瘤免疫功能障碍和排斥特征,克服了免疫疗法样本量小的问题。基于来自189项人类癌症研究的33,197个非ICB治疗样本,TIDE计算了每个基因与细胞毒性T细胞水平之间的相互作用,并采用标准化的Wald检验得分来预测患者对PD-L1治疗的反应。测试表明,TIDE在黑色素瘤患者中的预测性能优于其他已知生物标志物,但其适用性目前仅限于黑色素瘤与非小细胞肺癌。TIDE网站提供公共转录组数据集的访问和支持TIDE分数的分析工具。

03 ICB-Portal

ICB-Portal是一个综合平台,提供现有ICB疗法反应生物标志物的基准测试结果及详细分析,允许研究人员在线测试自定义生物标志物以预测治疗效果。该平台基于29个转录组数据集,涵盖了5种癌症类型的超过1,400名患者的数据,评估了39个转录组生物标志物和48个评分系统的效能。

04 TIGER

TIGER(肿瘤免疫治疗基因表达资源)是一个整合了单细胞转录组数据的平台,并提供广泛的分析模块以预测ICB疗法反应。它包含来自18个bulk转录组数据集的超过1,500个带有临床结果的肿瘤样本,以及超过210万个来自655个样本的免疫细胞单细胞测序数据,用于展示免疫细胞亚群的全貌。TIGER支持用户探索相关通路、轨迹映射及反应预测等功能。

05 IOhub

尊龙凯时致力于为医学研究人员提供更好的工具与资源,支持免疫治疗相关研究的深入发展。通过不断完善数据库与分析平台,我们期望为癌症免疫治疗领域的前沿科技贡献力量。